Boqdanoviç ilk peşəkar müqaviləsini 18 yaşında – 2010-cu ilin sentyabrında Serb komandası Partizan BK ilə imzalayıb. 2012–2013 sezonu onun komandası ilə keçirdiyi ilk Avroliqa sezonu idi.

2013–2014 sezonundan başlayaraq isə Boqdanoviç komandada liderliyi əlinə almağa başladı. Həmin sezon Avroliqada 23 oyuna 14.8 xal ortalaması ilə oynadı və nominasiyasına layiq görüldü. Adriatik liqası finallarında Partizan əzəli rəqibi 3-1 məğlub edərək Serb Liqasının çempionu oldu. Boqdanoviç isə final seriyasında hər oyun üçün ortalama 30.8 xalla oynadı və finalların Ən Dəyərli Oyunçusu seçildi.

26 iyun 2014-də keçirilən Foniks Sans tərəfindən seçildi.

2014-cü il 11 iyul tarixində Boqdanoviç komandalarından Fənərbaxça Ülkər ilə 4 illik müqavilə imzaladı.

Komandada yeni olmasına baxmayaraq elə ilk sezonunda Boqdanoviçə önəmli bir rol verildi və oyunlara ilk beşdə çıxmağa başladı. 7 May, 2015də Boqdanoviç bir daha Avroliqa Yüksələn Ulduz mükafatını qazandı və tarixdə sonra bunu bacaran ilk oyunçu oldu. Komandası Fənərbaxça isə Avroliqanın ¼ finalında 3-0 qalib gələrək tarixində ilk dəfə vəsiqə qazandı, amma yarı finalda Real Madrid ə, üçüncülük oyununda isə məğlub olaraq sezonu dördüncü bitirdi. Boqdanoviç isə Avroliqada sezon boyunca hər oyun üçün 10.6 xal, Türkiyə liqasında isə 11.5 xal ortalamaları ilə oynadı.

26 İyun 2014-cü ildə Boqdanoviç 2014 NBA seçmələrində Foniks Sans tərəfindən 27. Sıradan seçildi. 13 iyun 2017-ci ildə isə o, Sakramento Kinqz ilə müqavilə imzaladı.

Serbiya milli komandasında da forma geyinən Boqdan Boqdanoviç ilk dəfə 2009-cu ildə gənc milli komanda ilə forma geyinib. 2011-ci ildə isə Boqdanoviç milli komandanın heyətində yer aldı və finala qədər yüksəldi, amma onlar finalda Litvaya 85-67 məğlub olaraq gümüş medalın sahibi oldular.

Boqdanoviç Serbiya A milli komandasının formasını isə ilk dəfə -də geyinməyə nail olub. O, bu turniri hər oyun üçün ortalama 26.1 dəqiqə və 9.4 xal statistikaları ilə tamamlayıb. 2014-cü il Basketbol üzrə dünya çempionatında Boqdanoviçin də formasını geyindiyi Serbiya milli komandası məğlub olaraq gümüş medal qazanıb. Boqdanoviç isə bu turnirdə hər oyun üçün 12 xal ortalaması ilə yadda qalıb.

Serbiya milli komandası -i 4-cü olaraq bitirərkən, Boqdan Boqdanoviç həmin turnirdə oynadığı doqquz oyuna əsasən hər oyun üçün ortalama 8.9 xal atması ilə yadda qalıb.