Məhərrəm Babayev 13 yanvar 1937-ci ildə Bərdə şəhərində anadan olmuşdur. O, 1961-ci ildə Azərbaycan Kənd Təsərrüfatı İnstitutunu bitirmişdir. Azərbaycan SSR Torpaqşünaslıq və Aqrokimya İnstitutunda fəaliyyətə başlamışdır. Babayev 1963–1966-cı illərdə institutun əyani aspirantı kimi təhsilini davam etdirmişdir.

12 yanvar 2022 — AMEA-nın Fəxri fərmanı ilə təltif edilmişdir.

Məhərrəm Babayev 1966–1971-ci illərdə institutda elmi işçi, 1971–1975-ci illərdə baş elmi işçi olaraq çalışmışdır. Akademik 1975–1981-ci illərdə laboratoriya rəhbəri, eyni zamanda 1981–1985-ci illərdə Meyvə-Tərəvəz Təsərrüfatı Nazirliyi Elmi Tədqiqat Tərəvəzçilik İnstitutunda direktor vəzifəsini icra etmişdir. O, 1986–1989-cu illərdə Aqrar Sənaye Komitəsinin sədr müavini vəzifələrində çalışmışdır.

Məhərrəm Babayev 1995-ci ildən Azərbaycan Milli Elmlər Akademiyasının Torpaqşünaslıq və Aqrokimya İnstitutunda Torpaqların genezisi, coğrafiyası və xəritəçiliyi laboratoriyasının rəhbəri olmuş, 2001–2014-cü ilədək isə institutun direktoru kimi fəaliyyət göstərmişdir.

Azərbaycan torpaqlarının , təkamülü, morfogenetik diaqnostikası, nomenklaturası və təsnifatı, xəritələşdirilməsi, torpaqların torpaq-coğrafi məlumat bazasının hazırlanması.

1. Деградация почв под влиянием возрастающего антропогенного воздействия. Тез. док. III съезда Докучаевского общ.почв-в, Москва, 2000,. С.10–11
2. Degradation of soil in Azerbaijan influence increasing antropogen effect EUR 1723EN // European communities,- Italy, 2000, Р.71–74
3. Экологический мониторинг биогеоценозов Кура-Араксинской низменности // Тез.док. всес. межд. конф., Сыктывкар
4. Роль термоустойчивых микроорганизмов в самоочищении и рекультивации нефтезагрязненных почв сухих субтропиков Азербайджана — Матер. науч. межд. конф.,- Владимир,-Россия, 2004,. С. 244–245
5. Management of the processes of degraded soils rehabilitation in Azerbaijan by traditional methods. Elista, Republic of Kalmyk (Russian Federation), 2004,. Р. 7–8
6. Management of degraded soil rehabilitation processes in Azerbaijan traditional methods — UNESCO-MAB Dry lands series -France, Paris, No 4, 2005, p. 45–52
7. Современная классификация почв Азербайджана // Почвоведение, Москва, № 11, 2006,. С. 1307–1314
8. About the stability of soils to oil contamination along North Export Pipeline- 18th World Congress of soil science, Philadelphia, Pennsylvania, USA, 2006, Р/1–2
9. Biological methods of fertility reproduction of antropogen degraded irrigated soils in Azerbaijan dry subtropics Euro Soil 2008, (Vienna, Austria) p 106–107
10. Новая классификация антропогенных почв Азербайджана, 2010 г., г. Томск, Россия, Т.1, стр. 11–13, ISBN 5-91302-090-X
11. Developed characters of degradation of the irrigative soils in arid and subtropics zone of Azerbaijan Samsun-Turkey, may 26–28, 2010, p. 881–886, ISBN 978-975-7636-69-4
12. The methods of fertility reproduction of soils and the growth of high-quality fodder in Azerbaijan, Lozenge, Bulgaria, 2011, p. 12–17, ISSN 1313–7735
13. Исследование зависимости плодородия хлопчатника от концентрации солей в лугово- сероземных орошаемых почвах (Irragri Gleyic Calsisols) на Муганской равнине Азербайджанской Республики. Съезд Общ.,Поч-ов., Науч. Конф., Кн. 1, Петрозаводск, Москва, "Карельский научный центр РАН", 2012, с. 445
14. Biological indices–an obligatory component in the creation of the informational soil-geographical database4thInternational Congress Eurosoil, Bari-Italy, 2012, p.2234
15. The Institute of Soil Science and Agrochemistry of Azerbaijan National Academy of Sciences in independence years (1991–2011) Eurasian Soil Wokrshop, Samsun 2013, Turkey, p. 46–47
16. National Reference Base of Anthropogenic Soil Resources in the Azerbaijan RepublicBishkek, Kyrgyzstan, 2013, Volume 2, Number 2 (1), Special Issue for Agricasia "1st Central Asia Congress on Modern Agricultural Techiques and Plant Nutrition ", p. 885–890

1. Орошаемые почвы Кура-Араксинской низменности и их производительная способность Баку: Элм, АН Аз. ССР, 1983 г., 175 стр.
2. Почвенная карта Азербайджана БККИ СССРИ НС, Москва, 1991 г., 1 стр.
3. Azərbaycanın torpaq xəritəsi BKKİ SSRİ NC, Moskva, 1991., 1 səh.
4. Tərəvəzçinin məlumat kitabı, Azərnəşr, II nəşr, 1992, 228 s.
5. Azərbaycanın torpaq təsnifatının WRB sistemi ilə korrelyasiyası, Bakı: Elm, 2002, 250 s.
6. Cənab Heydər Əliyəvin torpaqşünaslığın inkişafında rolu Bakı, 2003, 12 s.
7. Azərbaycan torpaqlarının morfo-genetik profili (az və rus. dil) Bakı:Elm, 2004, 202 s.
8. Şəkər çuğundurunun becərilmə texnologiyasının torpaq ekoloji və qidalanma şəraiti. Bakı, Elm, 2005, 79 s.
9. Ekoetika haqqında Azərbaycanda ilk dəyərli monoqrafiya. Bakı, 2005, 176 s.
10. Müxtəlif torpaq ekoloji şəraitdə tərəvəz bitkilərindən yüksək məhsul almağın idarə olunması. Bakı, Elm, 2007, 240 s.
11. Azərbaycanda torpaq ekspedisiyası və mühafizəsi. Bakı, 2010, 216 s.
12. Suvarılan torpaqların bərpası və qorunub saxlanılması. Bakı, 2010, 220 s.
13. Azərbaycan torpaqlarının morfogenetik diaqnostikası, nomenklaturası və təsnifatı. Bakı, 2011, 452 s.
14. Natural factors that can create danger for that part of the Baku – Tbilisi –Ceyhan oil pipeline passing through the Azerbaijan Republic and intending measures for preservation Baku: Elm, 2012, 112 p.

• 2001–2008-ci illər Azərbaycan MEA İnstitutu nəzdindəki doktorluq dissertasiyalarının müdafiəsi üzrə D.01.41 Dissertasiya Şurasının sədri
• 2009–2011-ci illər Ali Attestasiya Komissiyası Biologiya və Kənd təsərrüfatı elmləri üzrə ekspert komissiyasının sədri
• 2011-ci ildən hal-hazıra kimi yenidən doktorluq dissertasiyalarının müdafiəsi üzrə D.01.41 Dissertasiya Şurasının sədri
• 2007-ci il Azərbaycan MEA Biologiya bölməsinin büro üzvü və akademik katibinin müavini
• 2012-ci ildə АМЕА-nın nəzdində yeni yaradılmış Aqrar Bölmənin büro üzvü

• üzvü
• Rəyasət Heyətinin üzvü
• üzvü
• sədr müavini