Dubrovnik Respublikasının mərkəzi Dubrovnik, Xorvatiya-Ermənistan tarixi əlaqələrinin mərkəzi olmuşdur. Dubrovnikdə yaşayan çox sayda xaricinin arasında bir neçə erməni var idi. Dubrovnikin iki himayəçisi müqəddəs Zenobius və Zenobia Kilikiyadan olan erməni müqəddəslər idi. Raqusan Yepiskopu Raimondo Gallani 18-ci əsrin əvvəllərində Ankara və İstanbulun baş yepiskopu idi. Dubrovnik Respublikası Osmanlı İmperiyası katoliklərinin, o cümlədən Ermənistandakıların qayğısına qalırdı. Perastdan olan bir xorvat iezuit Yosip Marinoviç, 1783-cü ildə varlı bir erməni bankir Covanni de Serposanın istəyi ilə "Dissertazione polemico-critica sopra due dubbi di coscienza narahatlığı gli armeni cattolici" əsərini yazır. Marinoviç dissertasiyasında, Osmanlı İmperiyasındakı Romadakı ruhanilərin bir hissəsi tərəfindən təsdiqlənməmiş, Erməni Apostol Kilsəsinin monofizitindən rabbani ayinləri alan erməni katoliklərini müdafiə edir.

Marinoviçin işi erməni katoliklərinin probleminin son siyasi və mənəvi həllinə təsir edir. Avstriya və Rusiya İmperiyasının köməyi ilə Vatikan, erməni katoliklərinin Osmanlı İmperiyasında tanınmasına nail olur və 1830-cu ildə İstanbulda baş yepiskopluğunu qurur. Marinoviçin işləri Ermənistanın tarixinin müasir tədqiqatlarının əsasını qoymuşdur.

Xorvatlar Qondarma Erməni Soyqırımını Xorvatiyada tanımasa da, ermənilərə dərindən rəğbət bəsləyirlər. Xorvatiyada soyqırımın hərtərəfli öyrənildiyi qeyd olunur. Bu türk hökumətini Xorvatiya hökumətindən qondarma erməni soyqırımı istintaqının dayandırılmasını tələb etməsinə sövq etmişdir. Zagreb ittihamları rədd edir.

Ermənistan Xorvatiyanı 21 iyun 1994-cü ildə müstəqil bir ölkə olaraq tanıdı və ölkələr arasında diplomatik münasibətlər 8 iyul 1996-cı ildə quruldu. Ermənistan Xorvatiyada İtaliyanın Romadakı səfirliyi ilə təmsil olunur. Xorvatiya Ermənistanda Yunanıstanın Afinadakı səfirliyi vastəsi ilə təmsil olunur. Hər iki ölkənin fəxri konsulluqları var.