Bowtie — qısa DNT ardıcıllıqlarını böyük istinad genomlarına sürətli və yaddaş baxımından səmərəli şəkildə uyğunlaşdırmaq üçün istifadə olunan bioinformatika aləti.[3]
Bowtie | |
---|---|
Repozitoriya | github.com/BenLangmead/b… |
Proqramlaşdırma dili | C++[2] |
Əməliyyat sistemi | Linux, macOS |
Sonuncu versiya |
|
Sayt | bowtie-bio.sourceforge.net/… |
O, xüsusilə Next-Generation Sequencing qısaca NGS texnologiyalarında genom tədqiqatları, transkriptomika və epigenetika sahələrində geniş tətbiq olunur. Bowtie yüksək sürəti və az yaddaş istifadəsi ilə seçilir.
- ↑ Release 1.3.1. 2021.
- ↑ The bowtie-bio Open Source Project on Open Hub: Languages Page. 2006.
- ↑ Langmead, Ben; Cole Trapnell; Mihai Pop; Steven L Salzberg. "Ultrafast and memory-efficient alignment of short DNA sequences to the human genome". Genome Biology. 10 (3). 4 March 2009: 10:R25. doi:10.1186/gb-2009-10-3-r25. PMC 2690996. PMID 19261174.