Zəfər Murtuzov 1952-ci ildə Cəlilabad rayonunda anadan olub. 1971-1975-ci illərdə Azərbaycan Dövlət İncəsənət İnstitutunda təhsil alıb. 1977-ci ildə C. Cabbarlı adına "Azərbaycanfilm" kinostudiyasında rejissor assistenti kimi fəaliyyətə başlayıb, sonralar bir sıra filmlərin ikinci rejissoru olub.

Ailəlidir. bir qızı və bir oğlu var. Həyat yoldaşı Sevda xanım Şəkidəndir. "Həm ziyarət,Həm ticarət" filmindəki Mustafa müəllimin qonaqlıq səhnəsi Sevda xanımın atası İsgəndər doktorgildə çəkilib.

1 avqust 2018-ci ildə Azərbaycan kinematoqrafiyasının inkişafında xidmətlərinə görə, "Tərəqqi" medalı ilə təltif edilmişdir.

1. İstintaq (film, 1979)
2. Qızıl uçurum (film, 1980)
3. Babamızın babasının babası (film, 1981)
4. Park (film, 1983)
5. Şəhərli biçinçilər (film, 1986)
6. Yay gününün xəzan yarpaqları (film, 1986)
7. Doğma sahillər (film, 1989)
8. Təhminə (film, 1993)
9. Qayınana (film, 1978)