Şəhərlər — Yaponiyanın bələdiyyə səviyyəli inzibati vahidləri. və fərqli olaraq şəhərlər tərkibinə daxil deyillər və birbaşa tabedirlər. Şəhərlərin hüquqları "Yerli idarəetmə haqqında Yaponiya Qanunu" ilə müəyyənləşdirilir.

Əhalisinin sayı 50 min nəfəri keçən yaşayış məntəqələri bu statusu ala, əhalisinin sayı azalıb 50 mindən aşağı düşən yaşayış məntəqələri isə bu statusu itirə bilər. Yaponiyanın əhalisinin sayı ən az olan şəhərində — cəmi 6 min nəfər yaşayır. Amma məsələn, həmin prefekturaya daxil olan qəsəbəsinin əhalisinin sayı 40 minə yaxındır. Ən iri şəhərlər (əhalisi 200 mindən çox), (əhalisi 300 mindən çox) və ya hökumət qərarı ilə müəyyənləşdirilimiş (əhalisi 500 mindən çox) şəhər statusu ala bilərlər.

2010-cu il aprel ayının 1-nə olan məlumata görə Yaponiyada 786 şəhər var.