Xonqodorların ulu babaları Böyük Hun İmperiyasının tərkibində fəaliyyət göstərirdilər. Onlar Monqol İmperiyası dönəmində formalaşıb xalqa çevrildilər.Sayan-Baykal bölgəsinə köçənə qədər müasir Monqolustanın qərb tərəfində köç-düşlə məşğul olurdular.

Hazırda Xonqodorlar Buryatiyanın Tunkin, Okin, Zakamen rayonlarında və İrkutsk vilayətində yaşayırlar.