Start kodon

Start kodon — Başlanğıc kodonu, məlumat RNT (mRNA) transkriptinin ribosom tərəfindən tərcümə olunan ilk kodondur. Ən ümumi başlanğıc kodonu AUQ(yəni müvafiq DNT ardıcıllığında ATQ). Başlanğıc kodundan əvvəl 5' tərcümə edilməmiş bölgə (5' UTR) gəlir. Prokariotlarda bu ribosomun bağlanma sahəsini əhatə edir . Başlanğıc kodundan əvvəl 5 'tərcümə edilməmiş bölgə (5' UTR) gəlir. Prokaryotlarda bu ribosomun bağlanma sahəsini əhatə edir.

MT-ATP6 insan mitokondrial DNT geninin kodonunu (mavi dairə) başlayın. Nükleotidlərin hər üçlüyü üçün (kvadrat mötərizələr) müvafiq amin turşusu (bir hərfli kod) verilir, ya MT-ATP8 üçün +1 oxu çərçivəsində (qırmızı ilə) ya da MT-ATP6 üçün +3 çərçivədə (mavi ilə). Genomun bu bölgəsində iki gen üst-üstə düşür.

Alternativ başlanğıc kodları

Alternativ başlanğıc kodonları standart AUQ kodonundan fərqlənir və həm prokaryotlarda (bakteriya və arxey) həm də eukaryotlarda olur. Alternativ başlanğıc kodonları, zülalın başlanğıcında olduqda (kodon fərqli bir amin turşusu kodlaşdırsaydı belə), Met olaraq tərcümə olunur. Bunun səbəbi, başlanğıc üçün ayrı bir nəqliyyat RNT-nin (tRNT) istifadə edilməsidir .

Eukariotlar

Alternativ başlanğıc kodonları (AUQ olmayan)eukaryotik genomlarda çox nadirdir. Bununla birlikdə, bəzi hüceyrə mRNT-lərı üçün AUQ xaricində təbii olaraq meydana gələn başlanğıc kodonları bildirilmişdir. AUQ-də mümkün olan doqquz mümkün tək əvəzetməsindən yeddisi, məməli hüceyrələrdə tərcümə başlanğıc yerləri kimi fəaliyyət göstərən dihidrofolat redüktazın kodon başlanğıcı.

Candida albicans, CAG başlanğıc kodundan istifadə edir. .

Prokariotlar

Prokaryotlar, əsasən QUQ və UUQ alternativ başlanğıc kodlarından çox istifadə edirlər. E. coli% 83 AUQ (3542/4284), 14% (612) QUQ, 3% (103) UUQ [8] və bir və ya iki digərini (məsələn, AUU və ehtimal ki, CUQ) istifadə edir.

AUG başlanğıc kodonları olmayan tanınmış kodlaşdırma bölgələri, E. coli'nin lak operonundakı (QUQ) və (UUQ) bölgələridir. Daha iki yeni tədqiqat müstəqil olaraq 17 və ya daha çox AUQ olmayan başlanğıc kodunun E. coli-də tərcüməyə başlaya biləcəyini göstərdi.

Mitoxondiri

Alternativ başlanğıc kodonları (insanlarda AUA və AUU) mitoxondrial genomlarda daha geniş istifadə olunur..

Standart genetik kod

AUQ kodonu metionini kodlayır və başlanğıc yeri kimi xidmət edir: m-RNT kodlaşdırma bölgəsindəki ilk AUQ, zülala çevrilməyə başlayır. GenBank tərəfindən siyahıya alınan digər başlanğıc kodonları,eukaryotlarda nadirdir və ümumiyyətlə Met / fMet üçün kodlardır.

Mühəndislik başlamaq kodonları

Qurulmuş təşəbbüskar tRNT-lar (CUA antikodonu olan tRNT fMet2), UAQ amber stop kodonunda tərcüməyə başlamaq üçün istifadə edilmişdir. Bu tip mühəndislik t RNT-sına ümumiyyətlə UAQ kodonlarında baş verən tərcümə dayandırma siqnalını boğduğu üçün cəfəng bir supressor tRNT adlanır.

İstinadlar

  1. Lobanov, A. V.; Turanov, A. A.; Hatfield, D. L.; Gladyshev, V. N. . Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology. 45 (4). 2010: 257–65. doi:. PMC . PMID .
  2. Ivanov, I. P.; Firth, A. E.; Michel, A. M.; Atkins, J. F.; Baranov, P. V. . Nucleic Acids Research. 39 (10). 2011: 4220–4234. doi:. PMC . PMID .
  3. Peabody, D. S. "Translation initiation at non-AUG triplets in mammalian cells". The Journal of Biological Chemistry. 264 (9). 1989: 5031–5. PMID .
  4. Starck, S. R.; Jiang, V; Pavon-Eternod, M; Prasad, S; McCarthy, B; Pan, T; Shastri, N. "Leucine-tRNA initiates at CUG start codons for protein synthesis and presentation by MHC class I". Science. 336 (6089). 2012: 1719–23. Bibcode:. doi:. PMID .
  5. Dever, T. E. . Science. 336 (6089). 2012: 1645–6. doi:. PMID . 2022-06-08 tarixində . İstifadə tarixi: 2021-05-26.
  6. Santos, MA; Keith, G; Tuite, MF. . The EMBO Journal. 12 (2). February 1993: 607–16. doi:. PMC . PMID .
  7. Blattner, F. R.; Plunkett g, G.; Bloch, C. A.; Perna, N. T.; Burland, V.; Riley, M.; Collado-Vides, J.; Glasner, J. D.; Rode, C. K.; Mayhew, G. F.; Gregor, J.; Davis, N. W.; Kirkpatrick, H. A.; Goeden, M. A.; Rose, D. J.; Mau, B.; Shao, Y. "The Complete Genome Sequence of Escherichia coli K-12". Science. 277 (5331). 1997: 1453–1462. doi:. PMID .
  8. Sacerdot, C.; Fayat, G.; Dessen, P.; Springer, M.; Plumbridge, J. A.; Grunberg-Manago, M.; Blanquet, S. . The EMBO Journal. 1 (3). 1982: 311–315. doi:. PMC . PMID .
  9. Missiakas, D.; Georgopoulos, C.; Raina, S. . Journal of Bacteriology. 175 (9). 1993: 2613–2624. doi:. PMC . PMID .
  10. . 2020-06-23 tarixində . İstifadə tarixi: 2021-05-26.
  11. Firnberg, Elad; Labonte, Jason; Gray, Jeffrey; Ostermeir, Marc A. . Molecular Biology & Evolution (ingilis). 31 (6). 2014: 1581–1592. doi:. PMC . PMID .
  12. Hecht, Ariel; Glasgow, Jeff; Jaschke, Paul R.; Bawazer, Lukmaan A.; Munson, Matthew S.; Cochran, Jennifer R.; Endy, Drew; Salit, Marc. . Nucleic Acids Research (ingilis). 45 (7). 2017: 3615–3626. doi:. PMC . PMID .
  13. Elzanowski, Andrzej; Ostell, Jim. . NCBI. 13 May 2011 tarixində . İstifadə tarixi: 29 March 2019.
Mənbə — ""

Informasiya Melumat Axtar

Anarim.Az

Sayt Rehberliyi ile Elaqe

Saytdan Istifade Qaydalari

Anarim.Az 2004-2023