Yaponiya Sloveniyanın müstəqilliyini 17 mart 1992-ci ildə tanımışdır. İki ölkə arasında diplomatik əlaqələr 12 oktyabr 1992-ci ildə qurulmuşdur. 2006-cı ildə Yaponiyanın Sloveniyadakı səfirliyi açılmışdır.

2000-ci ildə Yaponiya şahzadəsi Sloveniyaya səfər etmiş və Sloveniya prezidenti ilə görüşmüşdür. 2013-cü ildə Borut Pahor Yaponiyaya səfər etmiş ilk Sloveniya prezidenti olmuşdur. O, Yaponiya imperatoru Akihito və baş nazir Şinzo Abe ilə görüşmüşdür. Pahor 2019-cu ildə növbəti dəfə Yaponiyaya səfər edərək Naruhitonun taxta çıxma mərasimində iştirak etmiş və Şinzo Abe ilə görüşmüşdür. Sloveniya baş nazirlərindən 2008-ci ildə, 2016-cı ildə Yaponiyada rəsmi səfərdə olmuşdur.

Sloveniyada bir sıra muzey və təşkilatlar yapon mədəniyyətinin təbliği ilə məşğul olur. 2013-cü ildə yaradılmış "Genki" təşkilatı Sloveniyadakı bu cür yapon dili və mədəniyyəti mərkəzlərindən biridir. Bu təşkilat tərəfindən hər il keçirilən "Yaponiya günü" tədbirinə minlərlə ziyarətçi qatılır. kolleksiyasına bir neçə yapon silahı və zirehi daxildir. Muzey 2017-ci ildə samuraylara həsr olunmuş sərgiyə ev sahibliyi etmişdir. şəhərində yerləşən XIX əsrin ikinci yarısında Avstriya-Macarıstan donanması ilə Yaponiyaya səfər etmiş sloven dənizçilərin özləri ilə gətirdikləri yapon əşyaları saxlanılır.

2006-cı ildə Sloveniyada ilk çado qrupunun əsası qoyulmuşdur. 2016-cı ildə Sloveniya Urasenke Tankokay Çado Assosiasiyası yaradılmışdır. Bu, Yaponiyadan kənarda olan 110-cu rəsmi nümayəndəsidir. 1985-ci ildən Yaponiyada yaşayan sloven fotoqraf yapon mədəniyyəti haqqında bir sıra əsərlər yazmış və sərgilər keçirmişdir.

2001-ci ildə Sloveniyanın şəhəri ilə Yaponiyanın şəhəri qardaşlaşmışdır. İki şəhər arasında mütəmadi olaraq təhsil mübadilələri baş verir.

1980-ci illərdə Sloveniya Şərqşünaslıq Cəmiyyətinin üzvləri yapon dili dərslərinin təşkili ilə məşğul olmuşdurlar. 1995-ci ildə Lyublyana Universitetinin incəsənət fakültəsində yaponşünas tərəfindən asiyaşünaslıq kafedrası yaradılmışdır. Burada çin və koreya dilləri ilə yanaşı yapon dili də tədris olunur. 2008-ci ilin noyabrında Maribor Universitetində yapon dilinin tədrisi başlasa da, dəsrlər maliyyə problemlərinə görə dayandırılmışdır.

2009-cu ildən etibarən Sloveniyada yapon dili natiqliq müsabiqəsi keçirilir. 2014-cü ildə Lyublyanada Avropa Yaponşünaslıq Assosiasiyasının konqresi keçirilmişdir. 2015-ci ildə Sloveniya Yaponşünaslıq Mərkəzi, 2016-cı ildə Sloveniya Yapon Dili Təhsili Assosiasiyası yaradılmışdır. 2017-ci ildə Sloveniyada ilk JLPT imtahanı baş tutmuşdur.