Sabancı Universitetinin qurulma prosesi, ali təhsil müəssisələrini özəl fondlara açmaq və fəaliyyət göstərmək hüququnun tanınması ilə başladı. Sabancı Qrupu, 1994-cü ildə Hacı Ömər rəhbərliyi ilə Sabancı Universitetinin təsis qərarını qəbul etdi. 1995-ci ilin avqustunda, 22 fərqli ölkədən, müxtəlif universitetlərdən, elm mərkəzlərindən 50-dən çox alim, tədqiqatçı, tələbə və iş adamı İstanbulda bir araşdırma konfransında bir araya gəldi. Konfrans salonunda qurulacaq universitetin fəlsəfəsinin "Birlikdə yaradılması və inkişaf etdirilməsi" qərara alındı. Bu konfrans tələbə istiqamətləri araşdırması və akademik proqramlar tərəfindən dəstəklənən dizayn komitələrinin işi ilə izlənildi. Sabancı Universitetinin yaradılmasına icazə verən qanun 5 iyun 1996-cı ildə qəbul edildi və Universitet şəhərciyinin təməli 31 iyul 1997-ci ildə qoyuldu. Universitet ilk tələbələrini salamlayaraq 1999-cu ilin oktyabr ayında tədrisə başladı.

Sabancı Universitetinin təməl prinsiplərinə uyğun olaraq tələbələrin fənlərarası təhsil alması və məktəbin akademik quruluşu buna uyğun tərtib edilmişdir. Sabancı Universiteti 3 fakültə və 1 dil məktəbindən ibarətdir:

• İncəsənət və Sosial Elmlər Fakültəsi
• Mühəndislik və Təbiət Elmləri Fakültəsi
• İdarəetmə Fakültəsi
• Məktəbi

Universitet, "Türkiyənin ilk fakültəsiz universitetidir." Öyrəşilmiş "fakültə" sisteminin fənlərarası qarşılıqlı təsirinin, təhsildə erkən və məhdud professionallaşmanın qarşısını alması səbəbiylə universitetdə akademik fakültə yoxdur. Universitetdə oxumaq istəyən tələbələr universitetə qəbul imtahanının nəticələrinə əsasən seçim edərkən fakültə deyil, müəllim və sinifləri seçirlər.

İki illik Vəqf İnkişaf Proqramına başlaması üçün universitetdə oxumaq hüququ qazanan tələbələr üçün universitetin bilik imtahanından keçməli və ya TOEFL IBT, SAT, , CPE, , , , , , imtahanından uğurla keçməlidirlər. Digərləri İngilis hazırlıq sinifini uğurla başa vurduqdan sonra Vəqf İnkişaf Proqramını davam etdirmək hüququna malikdirlər.

Tədris sisteminin infrastrukturunu təşkil edən "Vəqf İnkişafı Proqramı" zamanı tələbələr müxtəlif fənlərdən kurslar alaraq bütün lisenziya proqramları ilə yaxından tanış olmaq imkanı əldə edirlər.

Vəqf İnkişaf Proqramı iki mərhələdən ibarətdir. Birinci mərhələdə bütün tələbələr, elm, ictimai elmlər və bu sahələrə aid digər fənlərin bütövlükdə idarə olunduğu Universitet Kurslarını alırlar. Vəqf İnkişaf Proqramının ikinci mərhələsində tələbələr oxumaq istədikləri proqramın giriş kurslarını alırlar.

Tələbələr heç bir əlavə imtahan vermədən 13 proqramdan öz fakültələrini seçirlər.