Orta təhsil aldığı Azərbaycan Dövlət incəsənət Gimnaziyasinin xoreoqrafiya şöbəsini 2004-cü ildə bitirib. Həcər Ağayeva 2005-ci ildə S.Vurğun adına Dövlət Rus Dram Teatrının nəzdində aktyorluq studiyasını bitirib.

2004-2009 illərdə Azərbaycan Dövlət Mədəniyyət və İncəsənət Universitetinin Teatr rejissoru fakültəsində təhsil alıb. 2004-cü ildən S.Vurğun adına Rus Dram teatrın aktrisasıdır.

Akademik Milli Dram Teatrında, ÜNS Teatrında, Teatr Xadimləri İttifaqının nəzdində Gənc Aktyorların laboratoriyasında tamaşalarda çıxış edib.

17 mart 2021-ci ildə Azərbaycan Respublikasının əməkdar artisti fəxri adına layiq görülmüşdür. 9 may 2024-cü ildə Prezident Mükafatına layiq görülmüşdür.

1. Bir dəfə Qafqazda (film, 2007)
2. Cavid ömrü (film, 2007) (rol: Firəngiz)
3. Tanrıverdinin nağılı (film, 2008) (rol: Şəms)
4. Laplandiyalı qonaq (film, 2009)
5. Sonuncu dərviş (film, 2009) (rol: Maral Rəhmanzadə)
6. Aramızda qalsın (film, 2011-2013) (rol: Əfsanə)
7. Vəkil hanı? (film, 2011) (rol: Esya)
8. Şəbəkə (film, 2011) (rol: Fəridə həkim)
9. Sirr (serial, 2012) (rol: Gülnaz)
10. Həyat sən nə qəribəsən (teleserial, 2013)
11. 2 ömür (film, 2016-2017) (bədii serial) (rol: Səhər)
12. Həddən artıq uyğunluq (film, 2016)