"Bandırmaspor"un qurulmasından əvvəl Bandırmada "İdmanyurdu Gənclik" və "Mərmərə Gənclik" olmaq üzrə iki həvəskar futbol klubu fəaliyyət göstərirdi. 1965-ci ildə bu iki həvəskar futbol klubu birləşməyə qərar vermişdir. 1965-66 mövsümündə "Balıkəsir Bandırmaspor" tünd-qırmızı və ağ rənqlərlə qurulmuş və Türkiyə 2-ci divizyonuna qatılmışdır. 2-ci divizyona qatılmasıya Türkiyədə peşəkar liqalara qatılan ilk ilçə klubu olmuşdur.

İlk mövsümündə Qırmızı qrupu 6-cı yerdə bitimişdir. 1966-67 mövsümündə Bandırmaspor Türkiyə kubokunda yarım-finala qədər irəliləmiş, sonda "Altay"a uduzmuşdur. Ertəsi mövsüm kubokda ¼ finala qədər çıxan klub "Qalatasaray"a məğlub olmuşdur. 1973-74 mövsümündə 15-ci yeri tutaraq Türkiyənin 3-cü divizyonuna yuvarlanmışdır. Növbəti mövsüm Ağ qrup lideri kimi yenidən 2-ci divizyona qayıtmışdır. Uzun illər 2-ci divizyonda mübarizə aparan "Bandırmaspor" 1986-87 mövsümündə B qrupu axırıncı yerdə tamamlamış və 3-cü divizyona düşmüşdür. 1988-89 mövsümündə qrupunu birinci bitirərək 2-ci divizyona çıxmışdır. 1992-93 mövsümündə yenidən aşağı liqaya düşmüşdür. Uzun illər burada oynayan klub 2004-05 mövsümündə qrupunda sonucu yeri tutaraq Həvəskar Liqaya yuvarlanmışdır.

2008-09 mövsümündə "Bandırmaspor" yenidən 4-cü liqaya yüksəlmişdir. Ertəsi mövsüm 3-cü divizyona çıxmışdır.

2015-16 mövsümünwn yekununda ağ qrupda üçüncü yeri tutan Bandırmaspor, pleyy-off matçları nəticəsində finalda "Gümüşhanespor"u 2-0 məğlub edərək 1-ci Liqaya yüksəldi.

•   Türkiyə 3-cü divizyonu
  • Çempion: 3 (1974-75, 1988-89, 2009-10)
•   Türkiyə Həvəskar Liqası
  • 3-cü divizyona yüksəlmə: 1 (2008-09)

"Bandırmaspor"un "Cinçuxuru", "Xroniklər" və "Panormos" adlı 3 fan-klubu mövcuddur. Ən əzəli rəqibi "Balıkəsirspor"dur.

• TFF-da