Azərbaycan Karate Federasiyası 1991-ci ildə yaranmışdır. Sonradan müxtəlif növlər (istiqamətlər) üzrə karate federasiyalarının (Şotokan, Qocyu-Ryu, Kosiki karate, Kyokuşin Kay, Fudokan Karate və.s) yaranması ilə əlaqədar bu federasiyaların fəaliyyətinin genişləndirilməsi və karatenin populyarlığın artırılması və daha inkişafına nail olunması məqsədilə 1997-ci ildə Azərbaycan karate federasiyaları Assosiasiyası təsis edildi və Ülvi Quliyev prezident, Füzuli Musayev vitse-prezident vəzifələrinə seçildilər.

Son illər ölkə rəhbərliyinin idman sahəsində islahatların aparılması sahəsində tövsiyələrindən irəli gələrək Azərbaycan Gənclər və İdman Nazirliyinin təşəbbüsü və təklifi ilə karate idman növünün daha da inkişafı, pərakəndəliyin aradan qaldırılması və Azərbaycan fəaliyyət göstərən karate federasiyalarının vahid təşkilatda birləşməsi məqsədilə 2023-cü ilin fevral ayında ümumi yığıncaq keçirilərək Azərbaycan karate federasiyaları Assosiasiyası fəaliyyətini bərpa etdi. Ümumi yığıncaq Ülvi Zahid oğlu Quliyevi yenidən AKFA-nın prezidenti, Füzuli Musayev, Fərid Əsgərov, Rəhman Hətəmov və Allahverdi Rüstəmov vitse-prezidentlər, və üzvləri "Şotokan karate-do federasiyası" İB-nin prezidenti Elçin Mehdizadə "Milli karate federasiyası" İB-nin prezidenti Yaşar Bəşirov, "Aşihara Kenkokan karate federasiyası" İB-nin prezidenti Maarif Bağırov, "Koşiki-karate federasiyası" İB-nin prezidenti Rəfail Bünyatov idarə heyətinə seçilmişdirlər.

AKFA sonradan beynəlxalq təsisatlara uyğunluğu məqsədilə adı dəyişdirilərək Azərbaycan Karate federasiyası kimi Azərbaycan Gənclər və İdman Nazirliyi Kolleqiyası tərəfindən müvafiq qərarı təsdiq edilən, akkreditayasiyadan keçirilərək status almış və karate üzrə yeganə tanınan federasiyadır.

27 iyul 2023-cü ildə AKFA adı dəyişdirilirək, Azərbaycan Karate Federasiyası adı ilə Ədliyyyə Nazirliyində dövlət qeydiyyatına alınmışdır.