Vaqif Hüseynov 1993–1994-cü illərdə Samux Rayon İcra Hakimiyyətinin başçısı vəzifəsini icra edib. O, 1993-cü ildə Gəncədə baş vermiş dövlət çevrilişində iştirakda və rayon prokuroru Şəmşir Əliyevin öldürülməsində günahlandırılaraq, oğlu və digər iki nəfərlə birlikdə həbs olunub. Məhkəmə Vaqif Hüseynov barəsində ölüm hökmü çıxarıb. Lakin sonradan onun cəzası ömürlük azadlıqdan məhrumetmə cəzası ilə əvəz olunub.

Şəkərli diabet və digər xəstəliklərdən əziyyət çəkən Vaqif Hüseynov 1 iyul 2015-ci ildə Ədliyyə Nazirliyi Penitensiar xidmətin Qobustanda yerləşən həbsxanasında vəfat etmişdir.