1993-cü ildə Qazaxıstan Respublikasının Prezidenti Nursultan Nazarbayevin Misir Ərəb Respublikasına rəsmi səfəri zamanı "Misir İslam Mədəniyyəti Universiteti Nur- adı altında birgə Qazaxıstan-Misir İslam ali təhsil müəssisəsinin açılması barədə razılaşmalar əldə edildi. Mübarək (ərəb. الجامعة المصرية للثقافة الإسلامية «نور مبارك»‎, qaz. «Нұр-Мүбарак» Египет ислам мәдениеті университеті). Alma-Ata şəhərində universitetin tikintisi üçün 6 hektar sahə ayrıldı. 16 may 1993-cü ildə Prezident Nursultan Nazarbayev və Misir Əqqaf naziri Məhəmməd əl-Məhcub təntənəli bir şəkildə gələcək universitet şəhərciyinin təməl daşını qoydular.

2000-ci ildə universitetin inşaatının birinci mərhələsi başa çatdı. Qazaxıstan nümayəndə heyəti ilə Misir hökuməti arasında universitet rəhbərliyinin Qazaxıstan Müsəlmanları Ruhani İdarəsinə verilməsi barədə razılıq əldə edildi. Bu müqavilə, Qazaxıstan Respublikası Parlamenti tərəfindən 2 iyul 2003-cü ildə təsdiqlənmiş, prezidentin 460–11 saylı fərmanı ilə təsdiq edilmiş və qüvvəyə minmişdir. Misir tərəfində, müqavilə 2003-cü ildə Prezident Hüsni Mübarəkin 215 saylı fərmanı ilə rəsmiləşdirildi.

Qazaxıstan və Misir nümayəndələrindən qəyyumlar heyəti quruldu və universitetin Nizamnaməsini təsdiqlədi, ona görə Misir vətəndaşı rektor, Qazaxıstan vətəndaşı isə rektor olacaq. Nur-Mübarək Universitetinin ilk rektoru akademik və professor Mahmud Fəhmi Hicazi, prorektor — filologiya elmləri doktoru, professor Şəmşədin Tursınulı Kərim idi.

Universitetin açılışından sonra "5B050600-İslamşünaslıq" kodu altında "İslamşünaslıq" peşəsi dövlət təsnifatına daxil edildi. Universitet tələbələri üç əsas ixtisas üzrə təhsil alma fürsəti əldə etdilər: "İslamşünaslıq" (5B050600), "xarici dillər" (5B011900) və "dini tədqiqatlar" (5B020600). Artıq universitetdə təhsil almaq istəyənlər dövlət qrantlarına müraciət etmək imkanına sahibdirlər; magistratura və doktorantura şöbələri açılmış, bir tədqiqat mərkəzi təşkil edilmişdir.

29 sentyabr 2010-cu il tarixində universitetə, ali və peşə təhsili sahəsində müəllimlik hüququ üçün sınırsız müddətə 0137466 saylı dövlət lisenziyası verildi.

• Universitet miqyasında humanitar fənlər kafedrası (qaz. Жалпыуниверситеттік гуманитарлық пәндер кафедрасы) — Şolpan Borantayevna Bayneş.
• İslam Araşdırmaları Bölümü (qaz. Исламтану кафедрасы) — Şəmşat Amangeldiyevna Adilbayeva
• Dini Araşdırmalar Bölümü (qaz. Дінтану кафедрасы) — Kalmaxan Seytoviç Yerjan
• Ərəb dili və ədəbiyyatı şöbəsi (qaz. Араб тілі және әдебиеті кафедрасы) — Məhəmməd Sibaqi
• Adına Araşdırma Mərkəzi Əbu Hənifə (qaz. Әбу Ханифа атындағы ғылыми-зерттеу орталығы) — Alau Şaykımulı Adilbayev
• Universitet hazırlıq kursu (qaz. Университеттің дайындық курсы)
• Mədəniyyət və təhsil mərkəzi (qaz. Мәдени-ағарту орталығы)
• Ərəb dilinin mərkəzi (qaz. Араб тілі орталығы) — Nəşət Abd əl-Əziz