1999-cu ilin iyun ayında Ford-dan Jackie Stewart-ın Stewart Qran-priFormula One komandası tərəfindən satın alındı. Ford, Jaguar Racing şirkətinin adını, Jaguar premium avtomobil şirkətini tanıtmaq üçün qlobal marketinq əməliyyatlarının bir hissəsi olaraq dəyişdirdi. Bu markadan istifadə etməyə baxmayaraq, onlar Cosworth mühərrikli avtomobillərdən istifadə etməyə davam etdilər, heç bir Jaguar mühəndisliyi istifadə olunmadı. 2000-ci ildə komandanı Fordun Premyer Automotive Group başçısı olan Wolfgang Reitzle idarə etdi.

Komandanın 1999-cu il Dünya Kubokunun ikinci üzvü Eddie Irwinni keçmiş pilot Stuart Johnny Herbert ilə əməkdaşlıq etdi, lakin bu mövsüm Stewart 1999-cu ildə əldə edə biləcəyi nəticələrə uyğun gəlmirdi. Nəticələr 2001-ci ildə də yaxşı olmadı. Hətta ilin ortalarında FIA F1 in 3 qat dünya çempionu Niki Lauda nın təyin olunmasına baxmayaraq, komandaya mənəvi kömək olmadı və komanda yenidən geri düşdü. 2003-cü ildə komanda John Hogan tərəfindən idarə edildi. Yaxşı rəhbərlik və resursların daha səmərəli istifadəsi komandanın inkişafına səbəb oldu.

2004-cü ildə nəticələrin sabitləşməsinə baxmayaraq, komanda ardıcıl əsaslarla ballar qazanılmırdı. Əvvəlki iki ildə ardıcıl stabil nəticələr əldə edilməsinə baxmayaraq, 2004-cü ilin sonuna yaxın Ford əməliyyatını satmağı seçdi. 2004-cü ilin noyabr ayının ortalarında enerji içki şirkəti Red Bull Jaguar Formula 1 komandasını Fordʼdan aldı.