Yaşar Musayev 1991-ci ildə AzTU-da fəaliyyətə başladığı dövrdə iki il "[[Maşınqayırma texnologiyası]]" kafedrasında tədqiqiatçı-mühəndis kimi çalışır. Bu müddətdə o kafedrada uyğun fənlər üzrə mühazirə və məşğələ [[dərs]]lərinin təşkili və keçirilməsində yaxından iştirak edir, tələbələrə layihə və [[diplom]] işlərinin tərtibində rəhbərlik edir. 1993-cü ildən Yaşar Musayev AzTU-da yeni yaradılan "[[Maşın]]ların [[təmir]] [[texnologiya]]sı və etibarlığı” [[kafedra]]sının təşkilində yaxından iştirak edir. 1993-1998-ci illərdə bu kafedrada o assistent vəzifəsindən [[dosent]] vəzifəsinə qədər yüksəlir. Pedagoji fəaliyyəti dövründə maşınların təmir texnologiyasının əsasları, əsasən də yeyilmiş hissələrin işləmə qabiliyyətini bərpa etmək üçün [[örtükçəkmə]] texnologiyalarının tədqiqi və tədrisi sahəsində onlarca elmi-metodiki işlər hazırlamışdır. Həmin kafedrada çalışdığı müddətdə tələbə işlərinə rəhbərlik etmişdir. Yaşar Musayevin rəhbərliyi altında diplom işlərini hazırlamış azərbaycanlı mühəndislərdən bir neçəsi [[Almaniya]]da [[doktorantura]]da təhsillərini davam etdirmişlər. Onlar hazırda alman sənayesinin müxtəlif sahələrində çalışırlar. Bu mühəndislərdən Almaniyada ən çox uğur qazananlar arasında [http://www.ixun-lasertechnik.de/ İXUN Lasertechnik GmbH] firmasının sahibi Dr. [[Xudaverdi Kərimov]]u və Şeffler qrupda avtomobil hissələrinin ötürmə hissələrinin layihələndirilməsi şöbəsində çalışan konstruktor Dr. [[Pərviz Mövlazadə]]ni göstərmək olar.