1964-cü ildə Pedro Ramires Vaskes, Xorxe Kampuzano və Rafael Mixares hazırladığı layihə əsasında iç həyətdəki böyük hovuzun yörəsində sərgi salonları və boyük daş dirəyin üzərində kvadrat daş çətir ("el paraques" kimi bilinir, ispanca "çətir"), onun yörəsində süni şəlalə olmaqla təsirli bir memarlı örnəyi yaradıldı. Zallar bağlar və çoxlu eksponatlarla əhatələnib. Muzey 23 otaqdır 79,700 m² (təxminən 8 hektar) yaxud 857, 890 kv. ayaq (feet) (təxminən 20 akr) torpaqda yerləşib.

XVIII yüzilin sonlarında Lorenso Boturininin topladığı sənədlərin bir hissəsi Meksika Papa Universiteti və Royaldakı Buqarelli canişininin göstərişi ilə yerləşdirildi. İspaniyayaqədərki tarixi və incəsənət abidələrinin dəyərlərini yayan von Humboldt|Aleksandr von Humboldt kimi elm adamları XIX yüzil muzeylərinə baş çəkdilər. Təxminən 1865-ci ildə İmperator muzey binasının Kasa de Monedadakı Moneda küçəsi 13 ünvanına köçürülməsinə icazə verdi. Təxminən 1906-cı ildə Xusto Sierra Milli Muzeyin eksponatlarının çoxluğuna görə onları böldü, oradakı təbii tarixi eksponatları xüsusi olaraq sərgi üçün tikilmiş Çopo binasına köçürdü. 1910-cu il sentyabrın 10-da prezident Porfirio Diazın iştirakı ilə muzey yeni adla - Milli Arxeologiya, Tarix və Etnoqrafiya adı ilə yenidən açıldı. Təqribən 1924-cü ildə muzeyin fondundakı eksponatların sayı 52000-dək artırılmış və 250 000-dən artıq ziyarətçi qəbul etmişdi.

1940-cı ilin dekabrında muzey yenidən bölündü, onun tarixi koleksiyalası Çapultəpə qalasına köçürüldü, çağdaş Meksikanın inkişafı və Yeni İspaniya krallığının diqqəti ilə burada Milli Tarix Muzeyi kimi formalaşdı. Qalan Meksika Kolumbiyası öncəsi və Çağdaş Meksikanın etnoqrafiyasına aid kolleksiya Antropologiya Milli Muzeyi adlandırıldı.

Yeni muzey binasının tikintisi 1963-cü ilin fevralında Çapultə parkında başladı. Yeni layihəni memar Pedro Ramires Vaskes, yardımçıları Xorxe Kampuzano və Rafael Mixares hazırladı. Yeni binanın tikintisi 19 aya sonlandı və 1964-cü il 17 sentyabrda açılış oldu, prezident Adolfo Lopez Mateoz çıxış etdi:

Meksika xalqı bu abidəni Respulkia ərazisində Kolumbiyaöncəsi yaşamış heyranedici mədəniyyətlərin şərəfinə qaldırdı. Bu abidə bugünkü Meksikanın, Meksikanın yerli əhalisinin mədəniyyətlərinə, onların əsilliyinə olan ehtiramının ifadəsidir.

Muzeyin eksponatları sırasında Günəş daşı, Tabasko və Verakruz cəngəlliklərindən tapılmış Olmek sivilizasiyasının böyük daş başları, Mayya sivilizasiyasından bəri qorunan xəzinələri, Çiçen İtzada Müqəddəs Senodda yerləşdirilən Palanqedəki Pakal qəbrindən sarkofaq qapaqlarının nüsxəsi və çağdaş Meksika kənd həyatının etnoloji mənzərələri var. İndiki Meksikanın ortasında (mərkəzində) həmçinin Aztek paytaxtı Texnotitlanın keçmiş planı və yerləşmə modeli də var. Daimi sərgilər indiki Meksika ərazisini və İndiki ABŞ-nin güney-batısı olan keçmiş Meksika ərazisini əhatə edən bütün Kolumbiyaöncəsi sivilizasiyanı içərən aşığı mərtəbədədir. O sərgilər Quzey, Batı, Mayya, Meksika körfəzi, Oaxaka, Mexiko, Toltek, Teotiuakan olaraq bölünür. Birinci mərtəbədə İspaniyanın işğallarından bəri Meksikanın doğma Amerika əhalisinin mədəniyyətləri göstərilir.

Muzey həmçinin dünyanın digər böyük mədəniyyətlərinə də ev yiyəliyi etməklə diqqət çəkir. Qədim İspaniya, Yunan, Rusiya, İran, Çin, Misir eksponatları da diqqət mərkəzində olub.

•  
  Reproduction of the Temple of the feathered serpent in Teotihuakan
•  
  Disc of Mictlantecuhtli
•  
  Statue of Chalchiuhtlicue
•  
  Olmeca-Xicalanca - Cacaxtla bird man mural
•  
  Mural and model of Tenochtitlan, looking east
•  
  Ocelotl-Cuauhxicalli
•  
  Teocalli of the sacred war
•  
  Statue of Xiuhcoatl
•  
  Statue of Aztec goddess Coatlicue
•  
  Sculpture of Xochipilli
•  
  Aztec calendar stone
•  
  Skull covered with turquoise
•  
  Replic of Codex Borbonicus
•  
  Feather headdress of Moctezuma II
•  
  Relief of Tonina
•  
  Lintel 26, Yaxchilan
•  
  Ceramic of the Jaina Island
•  
  Reproduction of the mausoleum of the Palenque ruler, K'inich Janaab' Pakal
•  
  Mortuary mask of K'inich Janaab' Pakal
•  
  Frieze of Placeres
•  
  Mask of Chaac
•  
  Zapotec mask of the Bat God
•  
  Reproduction of the Tomb 105 of Monte Albán
•  
  Mixtec ceramic
•  
  Mixtec pectoral of gold and turquoise, Shield of Yanhuitlán
•  
  Olmec colossal head
•  
  Olmec wrestler
•  
  Tuxtla statuette
•  
  Reproduction of the sculpture of Mictlantecuhtli in the archeological site El Zapotal
•  
  Mask of Malinaltepec