Klub 18 mart 1900-cü ildə Flores Stempel, Corel Reser və Yohar Deyt tərəfindən yaradılıb. İlk liqa kubokunu 1918-ci ildə qazanıb. 1967-ci ildə növbəti dəfə çempionluğunu qazanarkən 112 qol ataraq rekord müəyyənləşdirib. 1971-ci ildə isə həm kubok, həm də liqada ən güclü klub adını qazanmış, eyni zamanda da Çempionlar Kubokunda "Panatinaykos" klubunu 2 cavabsız qolla məğlub etmişdir. 1979-cu ildə "Barselona" klubuna transfer olarkən klubda zəifləmə hiss olunurdu. 1985-ci ildə Kroyff məşqçilik vəzifəsinə gətirildi. Həmin ildə Ayaks o vaxtkı adı ilə Lokomotiv Leypziqə 1 cavabsız qolla qalib gəldi.

İlk yaradıldığı dövrdə klubunun stadionunun xüsusi adı yox idi. 1928-ci də Ayaks ev oyunlarını Yay Olimpiya Oyunları stadionunda keçirirdi. 1996-cı ildə klub "Amsterdam Arena"-ya köçür.

Ayaksın ilk loqosunda bir oyunçu təsvir edilmişdir. 1928-ci ildən isə Qəhrəman Ayaks portreti klubun loqosunda yer alır.